Năm 2010, Kiểm toán Nhà nước sẽ kiểm toán tại 155 đầu mối. Trong đó, lĩnh vực ngân sách nhà nước sẽ kiểm toán quyết toán ngân sách 32 tỉnh, thành phố trực thuộc trung ương, 14 bộ, cơ quan trung ương và 10 tổ chức chính trị xã hội, nghề nghiệp...

Đồng thời, Kiểm toán Nhà nước thực hiện ba cuộc kiểm toán chuyên đề đánh giá thực tế thực hiện gói kích cầu chống suy giảm kinh tế của Chính phủ gồm: kiểm toán việc phát hành, quản lý và sử dụng vốn trái phiếu Chính phủ giai đoạn 2006-2009; kiểm toán việc hỗ trợ lãi suất cho các tổ chức, cá nhân vay vốn ngân hàng để sản xuất, kinh doanh; kiểm toán công tác quản lý thu thuế (tập trung vào công tác hoàn, miễn, giảm, giãn thuế) trong hai năm 2008-2009 tại Tổng cục Thuế và Tổng cục Hải quan.